| Titre : | Research on Possible Structural & Functional Motifs in Amino Acids Degradation and Urea Cycles |
| Auteurs : | Abdelkrim Rachedi, Distributeur ; Raimes Mira, Auteur ; Bessaih Aicha, Auteur |
| Type de document : | texte imprimé |
| Editeur : | Alger: univ-saida, 2015-2016 |
| Format : | 65 p. / 30 x 17cm |
| Langues: | Français |
| Langues originales: | Français |
| Index. décimale : | BIOCHIMIE ET PHYSIOLOGIE CELLULAIRE |
| Mots-clés: | Protéine, Enzyme, Ligand, PDB, Acides Aminés, Motifs Structurales & Fonctionnels, Urée, Fonction, Base de données, Bioinformatique Structurelle. |
| Résumé : |
Ce projet a été entrepris dans le but de réaliser une étude sur les fondamentaux derrière la relation entre la structure et la fonction des protéines. La compréhension d'une telle relation est importante dans la découverte de la fonction biologique des protéines dans les deux situations normales et pathogènes. Une façon de réaliser l'étude de la fonction biologique des enzymes impliquées dans les voies métaboliques est d'examiner l'environnement de liaison des ligands de ces enzymes. Un ensemble d'enzymes impliquées dans la dégradation et Urée cycles Acides aminés a été sélectionnée pour l'étude présentée dans ce projet. Cette étude a nécessité l'utilisation des données de structure qui représentent les structures tridimensionnelles des enzymes dans un complexe avec leurs ligands (et / ou analogues). Les données structurelles liées aux enzymes impliquées dans les cycles métaboliques peuvent être extraites de la base de données international connu sous la Protein Data Bank ou PDB. Les structures tridimensionnelles de 16 protéines / enzymes extraites de la PDB ont été analysés dans cette étude en utilisant les techniques de la Bioinformatique Structurelle. L’étude a conduit à la découverte d'un ensemble de ce qu'on appelle ici comme Motifs Structurales & Fonctionnels qui sont considérés d'être importants dans la liaison des ligands par les enzymes et donc importants dans leur fonction. Ce travail a identifié, défini et caractérisés ces Motifs Structurales & Fonctionnels associés aux enzymes de cette étude et leurs ligands. Les calcules et les détails de liaison des ligands et leurs représentation graphique ont été stocké dans une base de données de type Flat-Files. Pour partager les données et les résultats avec la communauté scientifique aux niveaux local et international, une base de données en ligne a été crée et mis à disposition sur l’Internet à l'adresse web suivante: |
Exemplaires (2)
| Code-barres | Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
|---|---|---|---|---|---|
| SNVTM000233 | Biotm00233 | Périodique1 | Salle des Thèses | Mémoire | Libre accès Disponible |
| SNVTM000234 | Biotm00243 | Périodique1 | Salle des Thèses | Mémoire | Libre accès Disponible |
